本实用新型属于生物科学相关技术领域，具体涉及一种菌种取样装置，解决了现有技术中难以精确地控制样品量，而且一回只能采集单种样品的问题，包括外壳和取样机构，所述外壳表面开设有滑槽，所述滑槽一侧开设有刻度，所述外壳内部安装有取样机构，所述外壳内部安装有底板,所述底板下方安装有导管，所述底板上方安装有隔板,所述外壳与隔板之间设置有滑杆，所述滑杆下表面安装有密封垫，所述滑杆一端设置有调节杆，所述底板下方安装有吸头，在对菌群取样时，将吸头通过卡槽连接固定在导管上，向上推动调节杆，样品被吸头吸取通过导管进入装置，观察刻度来确定样品提取的体积，以此来对样品进行精准取样。