发明公开了基于疲劳损伤值估计的风电场功率优化调度方法及系统，通过在标杆机组安装的载荷传感器获取准确的弯矩载荷，通过雨流计数法及线性累积损伤理论得到标杆机组各部件的疲劳损伤值，以标杆机组的运行数据作为输入，标杆机组各部件的疲劳损伤值作为输出，训练优化疲劳损伤值神经网络模型，并采用粒子群优化算法，确定各台机组的发电功率，从而实现风电场内功率优化调度；本发明能够以较低的硬件成本获取全场机组的准确的疲劳损伤值，实现全场机组疲劳损伤值的动态均衡以及全场总功率设定值的精确跟踪，以及功率的优化调度，发挥疲劳损伤小的机组的发电能力，减轻疲劳损伤大的机组的压力，达到疲劳均衡的目的。