本实用新型公开了一种智能生态水族生物箱，属于水族生物技术领域，包括箱体、过滤主体结构和底部培菌过滤结构，过滤主体结构包括过滤仓和净水仓，过滤仓和净水仓分别设置有进水口和出水口，过滤仓的进水口和净水仓的出水口均连通箱体内腔；底部培菌过滤结构设置在箱体的底部，设置有水循环流道，水循环流道的进水端连通过滤仓的出水口，出水端连通净水仓的进水口；水族生物箱内的水流由所述进水口进入过滤仓过滤，由过滤仓出口流入底部培菌过滤结构，经水循环流道进入净水仓入口，最后由净水仓的出水口流入箱内。本实用新型能够有效的对水族箱内的水体进行培菌过滤循环，形成高效的净水过滤，是水族箱内的过滤系统形成良性循环，延长换水周期。