本发明提供了一种上行同步方法及装置、存储介质、终端及信关站，该方法包括：当接收到系统广播消息时，基于系统广播消息中包含的信关站的位置信息确定第一补偿时延；基于第一补偿时延通过该信关站对应的卫星向该信关站发送消息一，接收信关站反馈包含误差补偿时延的消息二；该误差补偿时延由信关站依据信关站侧补偿时延对消息一进行检测得到；依据第一补偿时延和误差补偿时延确定用户侧补偿时延，并基于用户侧补偿时延通过卫星向信关站发送消息三，使得消息三到达信关站的时刻与该消息三对应的目标接收时隙的边界对齐，以实现上行同步。能够将上行数据对齐到其对应的时隙边界，无需对每个TTI数据的起始位置进行维护，并且能够避免信关站丢帧。