本发明涉及一种提高作物抗盐性的海洋寡糖生物制剂及其制备方法。所述提高作物抗盐性的海洋寡糖生物制剂组成，包括分子量3000‑4000的甲壳低聚糖、龙须菜琼胶寡糖、胶冻样芽孢杆菌、氯化钙和水；其中甲壳低聚糖：龙须菜琼胶寡糖质量比为（1‑3）:0.5，优选的1:0.5；氯化钙10‑20 mmol/L，寡糖含量≥0.2%，有效活菌数≥2亿/mL。制备方法：1）制备甲壳低聚糖溶液；2）制备胶冻样芽孢杆菌发酵液；4）在常温下降将制得的甲壳低聚糖溶液、龙须菜琼胶寡糖和氯化钙按一定比例加入胶冻样芽孢杆菌发酵液中，并搅拌混合均匀，即得一种提高作物抗盐性的海洋寡糖生物制剂。所述一种提高作物抗盐性的海洋寡糖生物制剂用于促进盐胁迫下辣椒种子萌发，能显著提高辣椒种子的萌发率，促进苗期生长发育，增强辣椒幼苗对盐胁迫的抵抗能力,也可适用于促进黄瓜、水稻等其他作物种子萌发和幼苗的生长。