本发明提供了一种抗菌面料及其制备方法和应用，所述抗菌面料包括依次层叠的抗菌耐磨层、抗菌基布和抗菌防水层；所述制备方法包括：将抗菌纤维丝纺织成基布，并将所述基布置于含有抗菌整理液和织物整理液的抗菌混合溶液中，浸轧并烘干，得到抗菌基布；将抗菌耐磨层的原料制成抗菌耐磨涂料，并将抗菌防水层的制备原料制成抗菌防水涂料，然后将所述抗菌耐磨涂料和抗菌防水涂料分别喷涂到所述抗菌基布的两面，得到所述抗菌面料。本发明所述的抗菌面料的三层结构均具备抗菌功效，实现了面料的整体抗菌，还具备防水和自清洁的功能，面料的强度较高，适用于箱包面料的制备；其制备工艺科学高效，应用价值极高。