本发明公开了一种包虫病新抗原Cystatin蛋白。本发明提供的Cystatin蛋白其氨基酸序列中含有如下中的全部或部分：SEQ ID No.1的第1‑25位、第32‑56位、第64‑84位、第89‑95位、第141‑147位、第155‑168位。本发明通过GeLS‑MS/MS技术，找到了一个包虫病新抗原Cystatin蛋白，可以用来制作ELISA试剂盒并用于临床检测人源包虫病。本发明检测14例术后包虫病人血浆和6例正常西藏人血浆，阳性检出率为93％，阴性检出率为100％。本发明扩充了包虫抗原库，对诊断人源包虫病有一定的贡献。