本实用新型公开了一种牙髓分离工具，包括离心管，所述离心管的上端开口处同轴固定有密封环，密封环的一侧通过连接带连接帽塞，所述帽塞从密封环内部插入，对离心管的上端开口进行密封，所述帽塞的上表面至下表面贯穿开设有通孔，在通孔的内侧壁处设有隔离组件，用于封堵通孔，使用注射器从帽塞的上端插入通孔内能够顶开隔离组件，向离心管内注射分解酶和培养液，拔出注射器后，隔离组件复位封堵通孔。本实用新型能够使离心管内的牙髓组织保持在一个封闭的环境内，避免外部环境对其造成污染，可以提高干细胞的活性。