本发明公开了纳米多孔微支架在组织再生修复中的应用，所述纳米多孔微支架为纳米载体‑海藻酸钠三维多孔微支架；所述纳米载体为介孔二氧化硅纳米颗粒；所述海藻酸钠为改性海藻酸钠；所述纳米载体‑海藻酸钠三维多孔微支架采用液氮速冻高速破碎法制得。所述海藻酸钠三维多孔微支架在组织再生修复中的应用的具体使用方法为：向制备好的微支架中加入微支架总体积50％～80％的PBS，得到可注射微支架，将其注射于损伤组织部位。本发明的纳米多孔微支架能够促进组织再生，高效促干细胞扩增和定向分化，可注射，临床实用性强。本发明还公开了纳米多孔微支架在促进干细胞增殖、促进干细胞分化、促进组织自我再生修复中的应用。