本实用新型公开了一种用于储存干细胞的冻存盒，包括上盒体和下盒体，所述下盒体的上表面向内部凹陷形成下容置槽，用于放置干细胞采集袋，所述上盒体的下表面向内部凹陷形成上容置槽，在上容置槽的开口处侧壁上呈环形分布贯穿开设有一圈进液孔，在上盒体与下盒体合盖后，上容置槽与下容置槽围成容置腔，将冻存盒放置液氮罐中后液氮从进液孔处进入容置腔，在上盒体上设置有负压吸引装置，用于加速液氮进入容置腔，本实用新型在保证盒体封闭效果的前提下，能够使液氮更加迅速的充盈血袋四周，使用效果好，而且，在取出冻存盒后，可以留取小部分液氮作为冷源，以保持盒体在等待开启时内部的低温状态，减少等待时间对冻存细胞复苏活率造成潜在影响。