本发明公开了一种系统仿真选择方法和系统，方法：获取待仿真电路板的端口位置信息；根据预设的三种仿真流程分别确定对应的仿真端口，三种仿真求解S参数：PCB与封装电路单独进行2.5D求解流程并级联得到最终S参数，PCB与封装电路结合并进行2.5D求解流程或3D全波求解流程求解最终S参数；执行三种仿真流程并记录仿真输出参数和仿真时间；根据外部选择以选定一种仿真流程并绑定待仿真电路板。系统用于执行方法。本发明通过获取待仿真电路板的仿真端口信息，根据仿真流程确定仿真端口，执行仿真流程并记录仿真输出参数和仿真时间，根据外部选择以选定一种仿真流程并绑定待仿真电路板，能够为待仿真电路板确定一个合适的仿真流程，提高仿真的效率。