本实用新型公开了一种微生物发酵装置，包括外壳和内胆，外壳与内胆之间设置有加热腔，外壳与内胆上端开口设置，外壳与内胆上端的开口位置设置有密封盖，密封盖上设置有进管，外壳的下端设置有出管，出管延伸到内胆中，外壳的下端中部设置有搅拌电机，搅拌电机的转轴与延伸到内胆中的搅拌轴连接，搅拌轴上设置有叶片；外壳和内胆的设置，在内胆出现损坏时能够将其拆卸后进行更换，因此节约了成本，而且更换方便。而且密封盖能够方便的拆卸下来，能够很好的观察内胆的情况和方便清洗。