本实用新型公开了一种食品微生物检测装置，包括底座，所述底座的顶端表面设置有工作台，所述工作台的顶端表面设置有固定柱，所述固定柱的底端表面开设有腔体。本实用新型中，承载台表面的观察皿置于固定柱底端表面的腔体内，避免观察皿长时间暴露于外部沾染空气中细菌，影响食品检测的精确度，同时腔体内电阻丝加热机构，方便对腔体的空气进行加热，从而方便对观察皿进行高温灭菌处理，其紫外线杀菌灯的设置，能够进一步的对观察皿进行杀菌灭菌，保证观察皿的洁净性，最后通过承载台、工作台、螺纹孔、螺纹杆和驱动电机的相互配合使用下，方便将承载台表面的观察皿自动移动至电子显微镜的下方，避免高温的观察皿烫伤检测工作人员。