本发明提供一种拼版优化方法及系统，二者均能：将拼版上的元素分组得到相应数量的元素分组；对元素个数大于1的每个元素分组均进行基于颜色的拼版优化；所述基于颜色的拼版优化包括：判断元素分组的元素占比是否大于占比阈值：若是，则对元素分组采用基于聚类的方法进行拼版优化，得到颜色由浅到深再到浅的元素序列；若否，则对元素分组采用二分优化算法进行拼版优化，得到颜色由浅到深再到浅的元素序列；将元素分组中全部元素在拼版上的位置信息由小到大的顺序进行排序，得到对应的拼版位置序列；利用最新得到的元素序列，对应更新拼版位置序列中拼版版位上的元素。本发明用于规避拼版项颜色对印刷工艺的影响并降低印刷人员的工作量。