本申请提供一种苦荞活性成分微胶囊清洗装置及生产线，包括传送平台；设置在传送平台上的清洗机；放置在传送平台的传送机构上的胶囊存放箱；清洗机包括至少两个依次排列的清洗板；清洗板能够覆盖胶囊存放箱；传送机构带动胶囊存放箱从清洗板下方通过；胶囊存放箱底部设有筛网；清洗板上设有多个通水孔；通水孔连接有水管；传送平台上设有与清洗板相对设置的集液槽；集液槽底部设有排水管；在保证微胶囊清洗效果的同时提高了清洗效率。