本发明提供了一种医药冷藏运输箱及控温方法，涉及医药冷藏运输箱技术领域，解决了现有技术中现有医药冷藏运输箱采用单一出风口与单一回风口设计，导致远离出风口的位置容易超温的技术问题。本发明改变现有单一出风口和回风口的结构，箱盖内形成出风风道且箱盖上设置若干与出风风道相连通的出风口，箱体内形成回风风道且箱体的内周向侧壁上设置若干与回风风道相连通的回风口，回风口靠近箱体的底部，多个回风口能与箱内顶部的多个出风口形成呼应，搅动箱内空气，让箱内的空气均匀流动起来，利于精确控温。本发明将压缩机制冷系统和加热器采用变频控制，启停更加及时，避免频繁启停导致的冷桥能耗损失，更利于更好地实现更持久的精确温控。