本发明公开了一种源自布拉迪酵母的酵母多肽及其制备方法和应用。一种源自布拉迪酵母的酵母多肽，名为FTP‑21，其全序列为：SWLSGGFKLKKSVVKRFKLCYCRRFCVF，SEQ ID NO:1。所述的多肽的制备方法，化学人工合成或者提取自布拉迪酵母CNCM I‑1079的发酵产物。多肽的用途，用于选择性的杀菌或者抑菌，包括E.coli K 88、E.coli K 12、Salmonella ATCC13076、S.aureus ATCC25923、C.perfringens ATCC13124；选择性的保留益生菌，包括Lactobacillus acidophilus ATCC4356、Bifidobacterium longum ATCC27533。所述的多肽的用途，用于调理犬猫肠道菌群以及促进营养吸收的饲料添加剂。所述的多肽的用途，用于制备改善犬猫炎症的免疫调控饲料添加剂。本发明酵母多肽分子量小，净电荷高，稳定性好，溶解性强，易消化吸收，并具有选择性的抗菌活性和安全性高等特点。