本实用新型涉及农业机械技术领域，公开了一种防止种子失活的农作物种子消毒装置，包括外壳，所述外壳前后两侧内壁固定连接有两个外滑轨，所述外滑轨内侧均匀分布着四个底座，所述底座内侧均转动连接有转轮，所述转轮外侧均设置在内滑轨的内部，所述外滑轨下侧固定连接有伺服电机，所述金属过滤网内部固定连接有两片螺旋形状的搅拌板，所述金属过滤网外侧前后两端均固定连接有内滑轨，所述外壳下侧设置有漏水孔，所述外壳底部固定连接有的废料收集槽。本实用新型中，药剂通过喷头注入设备，搅拌板将种子分离和向后移动，从设置在装置后侧的出料托盘收集，金属过滤网的孔洞将药剂分离，无须人工进行药剂与种子分离工作。