本实用新型提供一种种植顶板防水系统。所述种植顶板防水系统包括屋面板、防水层及植被种植层，所述植被种植层、防水层及屋面板依次层叠设置，所述防水层包括卷材防水层或涂料防水层，以及耐根穿刺防水层，所述耐根穿刺防水层设于所述卷材防水层或涂料防水层相对上方。本实用新型提供的一种种植顶板防水系统屋面种植可以维护屋面绿化的同时，也可以节能、蓄水，达到海绵城市要求的目的，使用耐根穿刺防水层成为可行，可以轻易达到耐根穿刺的目的。