本发明提供一种燃料电池电堆批量预处理活化方法及装置，通过对初装成型的电堆进行气密性检测，将气密性达标后的所述电堆转移至燃料电池电堆预活化装置上，预活化装置包括氢气循环系统、氮气循环系统、冷却液循环系统，控制系统和上位机等；进而通入冷却液，向所述电堆循环通入一定温度的冷却液，使所述电堆的温度上升并保持在设定温度；再通入气体，向所述电堆的阴极即空气入口循环通入一定流量、压力、湿度和温度的氮气，阳极及氢气入口循环通入一定流量、压力、湿度和温度的氢气；最终对所述电堆进行简易在线变电流活化，活化完成。本发明的方法及装置进一步提升了电堆的整体活化效率，降低了活化成本，为电堆的批量化生产提供重要技术基础。