本发明提供一种燃料电池气体扩散层连续疏水处理设备，包括：移取机构，用于将待处理的气体扩散层转送至浸渍‑沥干‑送出机构；所述浸渍‑沥干‑送出机构，用于对所述气体扩散层进行浸渍、沥干并转送至烘干机构；所述烘干机构，用于对所述气体扩散层进行烘干；所述收料机构，用于收取烘干后的所述气体扩散层。本发明的技术方案解决了现有的疏水处理设备和方法不能实现连续化生产的问题。