本发明公开了一种波纹流道燃料电池多物理场耦合计算简化方法，包括：建立简化全面积双向波纹流道燃料电池几何模型；建立该简化全面积双向波纹流道燃料电池几何模型的上切割截面、下切割截面完全一致的网格，对全面积单池的双极板进行布尔运算，分别获取三腔流体经分配区分配后反应区中各通道的流体流量；对该简化全面积双向波纹流道燃料电池几何模型进行结构力学分析，获得由于双向波纹流道双极板压缩后不同位置的变形状态的新膜电极扩散层；将新膜电极扩散层与新空气流体域结合替换所建立的简化全面积双向波纹流道燃料电池几何模型的膜电极结构和空气流体域，并获得简化全面积双向波纹流道燃料电池几何模型的修正模型。