本发明提供了一种燃料电池系统用膨胀机及燃料电池系统，属于燃料电池低温启动技术领域，解决了现有技术无法避免涡轮因低温结冰而导致损伤的问题。该装置包括膨胀机壳体，设于该壳体内的电机、叶轮、涡轮、温度传感器、电加热装置，设于该壳体外的加热装置控制器。膨胀机壳体上设有压气端进气口、压气端出气口、涡端进气口、涡端出气口。电机位于膨胀机壳体内中部，使得膨胀机壳体内两侧形成独立的压气腔、涡腔。电机的压气腔的输出轴上设有叶轮，电机的涡腔的输出轴上设有涡轮。温度传感器、电加热装置均设于涡端的膨胀机壳体内。该装置可实现涡轮的快速融冰破冰，降低低温环境、燃料电池系统异常停机情况下膨胀机涡轮损伤的风险。