本发明涉及燃料电池技术领域，具体提供了一种燃料电池双极板涂层装置，包括并排放置的清洗箱和涂层箱，升降组件用于带动箱盖上升或下降，丝杆滑台模组用于将箱盖运输至清洗箱或涂层箱的正上方；夹持组件包括安装板，安装板与箱盖固定连接，夹持气缸的活塞杆通过两个滑动件分别与两个连接臂铰接，连接臂能够以其与滑动件的铰接处为轴进行偏转，每个连接臂的两端各固定一个顶角件；清洗机构包括固定在清洗箱内壁的清洗管，清洗管上设置有多个喷嘴。通过连接臂和顶角件对双极板的边缘进行夹持，连接臂能够偏转进而带动双极板进行偏转，解决了极板水平进行进入清洗箱内，固体物质容易沉淀在双极板的上表面难以去除干净的问题。