本发明公开了一种燃料电池双极板胶线处理装置，涉及燃料电池技术领域，包括液压装置，还包括固定外壳，固定外壳内设有连接腔，固定外壳的上端设有连接组件，固定外壳的下端设有旋转组件和与固定外壳转动连接的旋转头，旋转头与旋转组件传动连接，旋转头的下端设有胶宽控制组件和控压组件，旋转头内设有与连接腔连通的连通腔，旋转头的下部设有与连通腔连通的出胶口，胶宽控制组件设置有两个，两个胶宽控制组件分别设置在出胶口的两侧。本发明能够涂覆不同宽度的密封胶，提高了适用性，且能够在密封胶的转折点和T型交叉点减小密封胶的宽度和出胶量，避免燃料电池挤压后形成硬点，提高了燃料电池内部结构之间的密封效果。