本发明涉及燃料电池技术领域，具体为一种燃料电池高性能阴极催化层及其制造工艺，包括下述工艺步骤：S1、配制催化剂浆料a；S2、配制催化剂浆料b：按3：1：4份量配制，取三份碳粉、一份铂黑和四份全氟磺酸树脂充分混合备用；S3、形成第一高效催化层；S4、形成高效锁水质子传导层；S5、形成第二高效催化层，通过在质子交换膜上交错涂覆有催化剂浆料a和催化剂浆料b，催化剂浆料b全氟磺酸树脂质量含量更高，由此保证高效锁水质子传导层具有更强的锁水能力及质子传导效率。本发明通过催化层结构改变，可以提高催化层内部的质子传导效率及催化层锁水能力，提高催化层在低增湿环境下的电性能。