本发明提供一种燃料电池控制方法、装置、电子设备及燃料电池，属于燃料电池技术领域，所述方法包括：确定燃料电池开始进行关机状态下的阳极吹扫，控制第一半导体制冷片与目标管路贴合的一面制冷；所述方法还包括在燃料电池开机状态下，根据目标部件的反馈信号，控制第二半导体制冷片与目标部件贴合的一面加热。本发明的燃料电池控制方法，通过在燃料电池的目标管路安装第一半导体制冷片，并在目标部件处安装第二半导体制冷片，可以在阳极关机吹扫时控制第一半导体制冷片制冷来加速水分冷凝进而从阳极排出，提高吹扫的效率，节省吹扫过程的氢气用量，并在开机时控制第二半导体制冷片加热来使得结冰的目标部件开始正常工作。