本发明提供一种多堆燃料电池系统功率管理集成装置及其工作方法。功率管理集成装置包括第一级功率管理器、第二级功率管理器、动力电池功率管理器及驱动装置功率管理器。第二级功率管理器通过DC/DC模块或直接与多堆燃料电池系统的全部燃料电池电堆相连接，用于设定各个燃料电池电堆的应输出功率。动力电池功率管理器用于管理动力电池系统的输入功率和输出功率。驱动装置功率管理器用于控制驱动装置运行状态。驱动装置能驱动负载运行。本功率管理集成装置根据负载的多种工作模式，通过建立数学优化模型得出不同工作模式下的最优功率管理方法。本功率管理集成装置及其工作方法能提高多堆燃料电池系统的效率和寿命，减小成本，提高性能。