本公开提供了一种导水双极板燃料电池的启停方法，包括接收电池启动信号；提高水箱内水的温度；将水箱内的水输入循环水腔中；将循环水腔中的水加压至第一预定值；判断循环水腔出水口的温度是否达到第二预定值；若循环水腔出水口水的温度达到第二预定值，启动电池。采用该导水双极板的启停方法，可以解决在零度及零度以下导水双极板燃料电池停止运行后，其内的残留水结冰、体积膨胀，导致双极板的结构受到机械损伤；同时在下次启动时，需要大量的热量来融化双极板内的冰，会耗费更多的能量的问题。