本发明提供了一种基于酿脓链球菌的免疫球蛋白G降解酶（IdeS）酶切的度拉鲁肽中多种修饰水平的分析方法。该方法样品制备过程非常简便，在蛋白天然结构的基础上进行酶切，对酶切产物进行还原后即可进行分析。后续所需的样品分析时间很短，仅需20min甚至更短的时间即可完成1个样品的分析，可用于大批量工艺优化样品的修饰分析以及原研品与仿制药各种修饰的对比分析。此外，酶切后的样品主要包含N‑端GLP‑1结构域肽段、C‑端的Fc/2肽段及未酶切的完整肽链，样品组成非常简单，样品中若存在修饰组分则非常容易在UV谱图或者质谱图中被发现，大大降低了修饰肽段被发现的难度。