本实用新型公开了一种水溶性化肥自动配料系统，包括：配料装置包括若干个盛放化肥原料的配料仓，配料仓通过管道与混料仓相连，混料仓上部设置搅拌器，配料仓底部均设置电磁阀，电磁阀、搅拌器均与控制器相连，控制器还与无线收发器相连；控制装置包括MCU以及分别与MCU相连的显示模块、通信模块，显示模块用于显示农作物以及农作物所需化肥原料类型，显示模块接收用户所触发的选择指令之后转发至MCU，MCU根据选择指令生成生产指令并将生产指令发送至配料装置；配料装置接收到生产指令之后转发至控制器，控制器根据控制指令控制电磁阀的关闭与开启。采用本实用新型，可以根据农作物种类将肥料的原料按照一定配比关系配置成化肥供农作物成长所需。