本实用新型提供一种全自动均质器，包括样品盘架、第一旋转驱动机构、清洗槽、消毒槽、刀头、刀头电机、升降驱动机构和换位驱动机构。采用本实用新型技术方案，样品盘架上可放置多个样品，升降驱动机构带动刀头进入均质位的样品试管内，刀头电机带动刀头高速旋转对样品进行均质处理，每处理一个样品之后，通过换位驱动机构和升降驱动机构带动刀头依次进行清洗和消毒；第一旋转驱动机构再将下一个样品试管转至均质位进行均质处理，再清洗消毒，直至完成所有样品的处理。一次自动处理多个样品，大大提高了样品前处理效率，均质速度快，减少交叉污染风险，安全性高。