本申请提供一种电位温热治疗仪的控制器，包括壳体和控制装置，所述壳体为空心结构，所述壳体上设置有触摸屏；所述控制装置设置在所述壳体内部，所述触摸屏的输出端连接所述控制装置的输入端；所述控制装置包括电源模块、温度模块、时间模块、电位模块以及超声波模块，所述温度模块、时间模块、电位模块以及超声波模块均连接所述电源模块。通过触摸屏可以实现对所述电源模块、温度模块、时间模块、电位模块以及超声波模块的调控，从而完成对电位温热治疗仪的控制。本申请提供的一种电位温热治疗仪的控制器，具有温度高低调节功能、电位强度调节功能、超声波强度调节功能以及定时功能等，解决了现有电位温热治疗仪的控制器功能单一的问题。