本发明涉及一种主动测定污染物来源的方法及系统，包括以下步骤：S1：选取特定污染物；S2：规划采样点，由移动式检测站前往采样点采样，获取该采样点的该特定污染物的浓度以及纬度和经度坐标；S3：根据风向选择以位于上下风处的两个采样点为一组，计算出至少3个等污染物浓度点；S4：连起等污染物浓度点形成线段，做线段的中垂线，各中垂线的交点处或者交点形成的离散点拟合圆的圆心即为污染物来源地。本发明的跟据风向和风速测定污染物来源的方法，通过主动规划采样点，能够通过污染物浓度和风速来测定该特定污染物来源，测定精度在5公里内，能够快速定位污染物来源。