本发明涉及一种基于分子探针的汞离子荧光分析方法，方法中分子探针的溶解试剂以及分子探针与汞离子相互作用时的溶剂均为乙腈，该分子探针与汞离子相互作用后荧光发射强度显著增强，荧光发射强度与汞离子浓度之间的良好线性关系来检测环境和人体中的痕量汞离子。本发明的基于分子探针的汞离子荧光分析方法灵敏度和准确度高，钙离子，钴离子，镁离子，镍离子，铜离子等离子对汞离子的检测均无干扰，体现了本发明的分子探针对汞离子具有较好的识别性，选择性高。