本实用新型公开了一种含氟废水零排放处理系统，所述系统包括：物化单元，主要将含氟废水与药剂充分接触反应，使得含氟废水中的氟或氟化物形成沉淀，得到含氟废水上清液和沉淀污泥；生化单元，含氟废水通过微生物降解的方式去除废水中的有机物等；过滤单元，生化出水通过两级过滤器和超滤膜后截留悬浮物等颗粒物；脱盐单元，用于对过滤出水进行脱盐处理，分别得到淡水和浓水。本实用新型通过投加除氟剂对含氟废水进行去氟处理，并采用生化净化去除含氟废水中的颗粒杂质以及有机物质等，无需通过投加大量的石灰沉淀废水杂质，避免产生大量的污泥而影响设备的正常使用，且不会对环境造成污染。