本发明公开基于物联网与大数据分析的水环境监测数据处理方法、系统及计算机存储介质，通过对城市内存在的各湖泊水域的水体水质参数进行检测，进而从中筛选出自净湖泊，并对自净湖泊内存在的所有水生植物进行植物种类识别，同时分别对各种水生植物对应的长势品质系数和水体自净能力系数进行分析评估，进而将各种水生植物分别按照其对应的长势品质系数和水体自净能力系数进行排序，得到各种水生植物的长势品质系数排序结果和水体自净能力排序结果，从而将各种水生植物的长势品质系数排序结果和自净能力排序结果进行对比，根据对比结果对自净湖泊内存在的水生植物进行针对性人工处理，实现了对自净湖泊水域自净能力的优化。