本发明公开了一种湿法脱硫系统协同处理球团脱硫灰的方法，球团脱硫灰制浆后，一部分与既有石灰石浆液作为脱硫剂进入既有湿法脱硫吸收塔制备石膏浆液，剩余部分作为深度氧化过程中的碱性沉淀促进剂；石膏浆液经石膏旋流器后得到溢流浆液和底流浆液，溢流浆液静置后得到溢流上清液和溢流固相物，底流浆液和溢流固相物脱水得到脱硫石膏；溢流上清液经深度氧化、絮凝沉淀、静置后得到澄清液和底泥；澄清液用于球团脱硫灰制浆；底泥经废水旋流器处理后得到前段污泥和脱硫废水，脱硫废水进入脱硫废水处理系统处理。该方法改进了现有技术中球团脱硫灰配比量低、浆液池易起泡溢流、脱硫石膏色度深品位差、脱硫废水处理系统污泥量大、浆液池易中毒等缺陷。