本发明涉及一种跨安全区的多系统协同建模的方法，先向安全三区编码管理服务发起资源id申请；如果没有可用空闲资源id、则生成资源id申请命令文本文件并传输到安全一区的接收目录下；安全一区生成相应的资源id序列，经正向隔离装置发送到安全三区编码管理服务；安全三区使用资源id创建数据记录，或对已有记录进行修改或删除后、将记录信息经反向隔离装置传送到安全一区，写入安全一区的数据库中。本发明满足了三区建模和维护的需求，也满足一三区不同系统间同时建模的需求；实现了一区模型能同步到三区、三区模型也能同步到一区，保证了一三区模型的一致性。