本发明公开了一种万能铣头高精度控制系统及控制方法，万能铣头高精度控制系统包括：高精控制调整模块，用于对确定的万能铣头铣削特征数据进行高精度控制调整；铣削工艺存储模块，用于存储基于不同铣削路径的多种预先设定的万能铣头铣削工艺标准，为万能铣头进行铣削控制提供参照指导依据。本发明解决了现有技术中采用万能铣头加工时，不能对万能铣头加工进行实时地监测控制，导致万能铣头加工控制精度低下的问题，本发明采用万能铣头加工时，可对万能铣头加工进行实时地监测控制，提高万能铣头加工控制精度。