本发明提供一种具有抗菌、抗氧化和保护生殖细胞功效的凝胶组合物及其制备方法与应用，所述凝胶组合物的制备原料以质量份数计包括：活性成分8‑30份、凝胶材料0.2‑3份、保湿剂5‑20份和水100‑500份；其中所述活性成分包括人参提取物、辅酶Q10和绿茶提取物。本发明创造性地将人参提取物、辅酶Q10和绿茶提取物3种成分进行搭配，三者相辅相成，通过各组分的协同增效作用，调配组合而得的活性成分具有显著的抑菌抗炎、抗氧化、清除自由基、改善生殖健康状态的效果。此外本发明还创造性地将活性成分用于制备凝胶产品中，凝胶产品配合超声的渗透作用，可促进凝胶中活性成分被机体吸收，进一步加强了凝胶组合物的原有功效。