本发明公开了一种多室袋制袋安全灌封一体机及制袋灌封方法，包括多室袋制袋灌封生产线，多室袋制袋灌封生产线沿着长度方向具有加工侧和辅助侧，加工侧依次由解膜工位、印刷工位、膜传送工位、周边热合隔离条焊接工位、弱焊工位、管口焊接工位组、袋体切割工位、袋体整型废边剔除工位、袋接收工位、灌装充氮工位和袋体输出工位构成，辅助侧依次由管口预焊接工位、管口供给工位、袋转移工位、封塞充保护气体工位组构成。本发明可以在制袋过程中能降低袋体输液部件与袋体焊接处的漏液几率，在灌装过程中可以进行快速灌装，可以满足不同规格、品种的多室袋的生产，具有设备布局合理，结构简单、紧凑、运行稳定、生产效率高等优点。