本发明提供了一种盐酸左氧氟沙星无菌凝胶剂的制备方法。该制备方法以盐酸左氧氟沙星为主药，凝胶基质、渗透压调节剂、pH调节剂、金属离子络合剂和抑菌剂为辅料，分别预先进行除菌处理后充分混合而得到质量百分比浓度为0.3％，pH范围为6.0～7.0盐酸左氧氟沙星无菌凝胶剂。该无菌凝胶剂，具有水溶性好，附着性强，溶出度高，作用持久，无油腻感和皮肤、粘膜刺激性等特点，既可用于细菌性结膜炎、角膜溃疡、泪囊炎、等外眼感染和皮肤烧、烫伤治疗，也可治愈皮肤局部细菌性感染。本发明提出的制备方法简单方便，产品无菌要求易于实现。