本发明公开一种离子液体胶原蛋白制剂及其制备方法和应用。该制备方法，包括步骤：提供左旋肉碱柠檬酸离子液体，所述左旋肉碱柠檬酸离子液体的结构式为：将所述左旋肉碱柠檬酸离子液体和胶原蛋白混合，并搅拌，然后依次均质、过滤、透析、浓缩，得到离子液体胶原蛋白制剂。本发明采用左旋肉碱柠檬酸离子液体递送胶原蛋白，可以在保持左旋肉碱柠檬酸离子液体优良性能的同时，克服传统ILs的毒性较大，不易代谢的缺陷。左旋肉碱和柠檬酸的引入，可实现抗氧化、去角质等功效，实现制剂在较低浓度下的高生物利用率，并赋予持续给药和缓释的效果。本发明离子液体胶原蛋白制剂具有吸收快、生物利用度高、起效快、性质稳定等特点。