本发明公开了一种二进制接口兼容性自动检查方法及装置，方法包括：建立兼容性检查的数据库，所述数据库中预设二进制接口的兼容性信息和接口定义详情；建立二进制接口兼容性检查任务，并关联待检查二进制目标信息表；解析出所述待检查二进制目标列表内兼容性信息，执行检查任务；将待检查二进制目标列表内的接口版本与所述数据库中预设二进制接口的接口版本进行对比；若对比结果判定为兼容，检查结束；若对比结果判定为不兼容，通知任务相关人进行兼容性处理；若对比结果判定为待定，将待检查二进制目标列表内解析出的接口定义信息与所述数据库中预设二进制接口的接口定义详情进行兼容性判断。