本发明公开了一种缓解过度运动引起的不良反应的益生菌组合物及应用，益生菌组合物由复合益生菌粉和辅料组成，所述复合益生菌粉由植物乳杆菌Lp3a、鼠李糖乳杆菌LR05、嗜酸乳杆菌LA16、发酵乳杆菌LF021、罗伊氏乳杆菌LR06、乳双歧杆菌Bla019和短双歧杆菌BB033组成，所述辅料由浓缩乳清蛋白粉、抗性糊精、低聚果糖、赤藓糖醇、乳糖醇和葡萄糖基甜菊糖苷组成，本发明通过益生菌之间的相互作用，可以调整肠道菌群平衡，抑制肠道不良微生物的增殖，有利于提高机体免疫力，改善人体机能，进而促进营养物质的吸收，能够有效缓解因过度运动造成的体重丢失。