本发明涉及一种多层超细纤维过滤材料及其制备方法，制备方法包括海岛纤维纺丝、无纺布的制备、无纺布收缩热定型、无纺布的开纤；制得的多层超细纤维过滤材料为无纺布，包括过滤层和超滤层，所述过滤层位于所述超滤层的上方，且所述过滤层的纤维与所述超滤层的纤维相互穿插；所述过滤层和所述超滤层均由超细纤维束构成，所述超细纤维束由定岛型海岛纤维开纤后获得；所述定岛型海岛纤维中，定岛以环岛分布多层，定岛岛径由内至外逐渐减小，定岛岛数由内向外逐渐增加。本发明有效解决了现有技术中的无纺布型过滤材料不断过滤沉积杂质颗粒导致通量严重损失的问题，过滤效率高，通量大。