本发明公开了一种基于FPGA的像素边缘位置检测方法、系统及存储介质，属于图像数据处理技术领域。本发明针对工业相机扫描得到的行数据进行处理，能够实时针对每一行图像数据进行边缘位置提取，通过设定亮区阈值、暗区阈值、连续亮区像素计数L、连续暗区像素计数M、亮暗过渡区域计数N，来进行边缘检测。若像素同一侧的N个像素的像素值，均位于设定的亮区阈值和暗区阈值之间，且该N个像素一侧的L个像素的像素值高于亮区阈值，另一侧的M个像素的像素值低于暗区阈值，则满足边缘检测条件。本发明能够有效地处理高速传输的大量数据，针对边缘点精度需求很高的场合，还可以利用边缘点附近多个像素梯度值计算出边界所处亚像素位置。