本发明公开了一种高含量α-亚麻酸微胶囊及其制造方法，包括芯材（α-亚麻酸产品，其中α-亚麻酸质量百分含量≥80%）及壁材（辛烯基琥珀酸淀粉钠），还包括乳化剂（亚麻籽胶），其中，芯材与乳化剂、芯材与壁材的重量配比分别为100-500：1及1-1.2:0.8-1。制造方法为：将1重量份的乳化剂溶于水中，配制成0.1%-1.0%的溶液，在其中加入100-500重量份的α-亚麻酸产品；再将辛烯基琥珀酸淀粉钠溶于水中，配制成13%-40%的溶液，辛烯基琥珀酸淀粉钠与α-亚麻酸产品的重量配比为0.8-1:1-1.2；最后将配置好的两种液体混合，经乳化、均质、喷雾干燥即得α-亚麻酸微胶囊粉末，其中，α-亚麻酸含量高、不易氧化、流动性好，总脂肪酸（W/W）≥50%，水分≤1.2%，表面油≤2%，α-亚麻酸≥400mg/g。