本实用新型涉及高分子材料加工技术领域，尤其涉及一种高分子材料自动化焊接加工机构，其包括加工底座、滑动设置于所述加工底座的加工支架和用于驱动所述加工支架沿水平方向滑动的加工驱动件、设置于所述加工支架的用于固定物料的定位组件和用于热熔物料的焊接组件。本实用新型通过设置用于固定物料的定位组件和用于热熔物料的焊接组件，当需要加工物料时，通过加工驱动件驱动定位组件和焊接组件靠近物料，定位组件固定住物料，然后焊接组件对物料进行加热焊接，从而对物料完成自动热熔焊接，相比于人工焊接，本系统自动化程度高，效率快，大量生产时可以降低生产成本。